流式细胞中心是细胞生态海河实验室共享技术平台的重要组成部分，是依托海河实验室的流式细胞技术保障系统。流式细胞中心配备有包括BD FACSAria Fusion、BD LSRFortessa X20和Cytek Aurora全光谱流式细胞仪在内的大型流式细胞仪，可进行多激光多色流式分析实验和高速高通量流式分选实验，利用免疫表型分析、细胞周期和倍体分析、细胞凋亡、磷酸化蛋白与细胞因子的检测以及细胞内PH值、活性氧、细胞因子、细胞内钙流、细胞膜电位、线粒体膜电位等细胞生理功能研究为手段，探索包括疾病细胞如炎症细胞、肿瘤细胞等的发生、发展和转归，基因表达和表达调控，细胞内信号传导和生物大分子间相互作用及生物损伤等机制研究。同时利用细胞表面标志分选不同分化阶段的细胞群，研究机体各个系统的发生发展及其调控的规律；建立小鼠动物模型，利用细胞表面标志分选不同细胞亚群，研究各亚群在自我更新、分化和归巢过程中的生物学特性。此外，分选单个细胞，并对其进行移植或基因注射研究，最终揭示生物发育、进化的基本规律。